Fakultas Peternakan (Fapet) Universitas Sam Ratulangi didirikan untuk menjawab kebutuhan sumberdaya manusia di bidang Peternakan pada tahun 1963. Berdasarkan Surat Keputusan Menteri PTI No. 96/63 tanggal 17 Agustus 1963, Fapet Unsrat menyelenggarakan  Program Studi Ilmu Peternakan. Dalam perkembangannya seiring dengan kebutuhan sumber daya manusia di bidang peternakan pada tahun 1983, Fapet Unsrat menyelenggarakan 3 Program Studi yaitu Sosial Ekonomi Peternakan, Nutrisi dan Makanan Ternak, dan Produksi Ternak.

Pada era reformasi terjadi perubahan kebijakan pemerintah yang menyatukan Departemen Pertanian dan Departemen Peternakan menjadi Departemen Pertanian Peternakan dan seiring dengan perubahan kebijakan pada Departemen Pendidikan dan Kebudayaan khususnya Pendidikan Tinggi berdampak pada pengelolaan Program Studi Fapet Unsrat sehingga pada tahun 2011 Fapet Unsrat menyelenggarakan satu program studi yaitu Program Studi Peternakan (PSP). Pada waktu itu terjadi resesi ekonomi, akan tetapi Fapet Unsrat tetap eksis. Walaupun dalam perjalanannya Fapet Unsrat mengalami pasang surut dalam jumlah mahasiswa, akan tetapi pada tahun 2019 Program Studi Peternakan (PSP) Fapet Unsrat mendapat pengakuan oleh BAN PT yaitu peringkat Akreditasi A.

Pada era pandemi Covid 19, Program Studi Peternakan (PSP) Fapet Unsrat mengalami berbagai tantangan. Tantangan terberat Program Studi Peternakan (PSP) Fapet Unsrat yaitu sejumlah orang tua mahasiswa mengalami masalah ekonomi sehingga mahasiswa mengalami kendala dalam menyelesaikan studi tepat waktu. Walupun demikian pada waktu itu Program Studi Peternakan (PSP) Fapet Unsrat meraih status peringkat akreditasi berstatus Unggul oleh BAN PT. Hal ini menunjukkan Program Studi Peternakan (PSP) mampu melewati masa sulitnya. Pada tahun 2022, Fapet Unsrat menyelenggarakan Program Magister Peternakan. Hingga saat ini setelah pandemi Covid 19, Fapet Unsrat tetap berupaya mengembangkan dan menjamin penyelenggaraan Program Tridharma Perguruan Tinggi.